苏雨晴回到现实世界后，全身心地投入到守护时空平衡的工作中。她凭借着在与林默冒险过程中积累的知识和经验，以及对古代文明的深入研究，在考古研究所建立了一个专门的时空研究小组。小组里汇聚了来自世界各地的顶尖专家，他们共同致力于探索时空的奥秘，预防可能出现的时空危机。
在一次对古代遗迹的研究中，苏雨晴发现了一些奇怪的能量波动。这些波动与他们之前遭遇神秘组织时感受到的力量极为相似，这让她心生警惕。经过深入调查，她发现是神秘组织的残余势力在暗中活动。这些人不甘心失败，企图再次寻找操控时空的方法，以完成他们未竟的阴谋。
苏雨晴带领研究小组对这些能量波动进行追踪，最终发现残余势力在一座偏远的山区建立了秘密基地。为了阻止他们的阴谋，苏雨晴决定带领一支精英小队前往山区。
当他们到达山区时，发现这里被一层神秘的能量罩所笼罩。能量罩上闪烁着诡异的光芒，似乎在阻挡着外界的入侵。苏雨晴利用自己对时空力量的理解，尝试破解能量罩的秘密。经过一番努力，她终于找到了能量罩的薄弱点，带领小队成功突破了进去。
进入基地后，他们发现残余势力正在进行一场危险的实验。他们试图利用一种古老的仪式，打开一个小型的时空裂隙，从中获取强大的力量。苏雨晴深知这种实验一旦成功，将会给世界带来巨大的灾难。
她带领小队与残余势力展开了激烈的战斗。在战斗中，苏雨晴发现这些残余势力得到了一种神秘力量的加持，他们的实力比想象中更加强大。但苏雨晴没有退缩，她利用周围的环境和自己的智慧，巧妙地应对着敌人的攻击。
就在战斗陷入僵局时，苏雨晴突然感觉到一股熟悉的力量。她抬头望去，只见一道光芒从时空裂隙中射出，一个身影缓缓浮现。这个身影竟然是林默！
林默的身体变得半透明，散发着柔和的光芒。他的眼神中充满了智慧和力量，仿佛已经与时空融为一体。
“林默！”苏雨晴激动地喊道。
林默微笑着看着苏雨晴：“苏雨晴，我感觉到了这里的危机，所以回来了。这些残余势力的阴谋不能得逞。”
林默加入战斗后，局势立刻发生了逆转。他运用时空力量，轻松地击败了残余势力的成员。那些神秘力量在林默面前，如同蝼蚁一般脆弱。
在林默的帮助下，苏雨晴成功阻止了残余势力的实验，关闭了时空裂隙。战斗结束后，苏雨晴和林默有了短暂的相聚。
“林默，你怎么会回来？你不是和时空之眼融合了吗？”苏雨晴问道。
林默解释道：“当我与时空之眼融合后，我发现自己并没有消失，而是获得了一种特殊的存在形式。我可以在时空的缝隙中穿梭，感知到世界的变化。当我察觉到这里的危机时，就赶了回来。”
苏雨晴听后，心中既惊喜又感动。她知道，林默始终没有忘记自己的使命，也没有忘记她。
然而，林默告诉苏雨晴，他不能长时间停留在现实世界。他与时空之眼的融合虽然修复了时空的平衡，但也让他与时空紧密相连。他必须时刻守护着时空，防止新的危机出现。
“苏雨晴，守护时空的责任还需要你继续承担。我会在时空的深处，默默地支持你。”林默说道。
苏雨晴点了点头，眼中闪烁着坚定的光芒：“你放心吧，林默。我会继承你的意志，守护好时空的平衡。”
林默和苏雨晴告别后，再次消失在了时空的缝隙中。苏雨晴知道，他们可能很久都不会再见面，但她相信，只要世界需要，林默一定会再次出现。
回到考古研究所后，苏雨晴继续带领研究小组进行时空研究。他们在探索中发现了更多关于时空的秘密，也开发出了一些能够预防时空危机的技术。
随着时间的推移，世界逐渐恢复了往日的平静。人们在和平的环境中生活，没有人知道曾经发生过多么可怕的危机。但苏雨晴知道，时空的守护永远不会结束，她和林默的故事，也将永远流传下去。